DOI: 10.32900/2312-8402-2022-128-94-104
Ключові слова: поліморфізм, популяція, корови, алель, генотип, гаплотип, зчеплення, маркер
Проведено дослідження генетичної структури популяції корів української чорно-рябої молочної породи за локусами бета-казеїну (CSN2) та капа-казеїну (CSN3), проаналізований розподіл частот гаплотипів. Поліморфізм дослідних локусів визначали за використання методів AS-PCR (алель-специфічна ПЛР) у випадку з CSN2 та PCR-RFLP (рестрикційний аналіз) у випадку з CSN3. За результатами досліджень визначали частоти генотипів та алелей, значення фактичної (Ho) та очікуваної гетерозиготності (He), індекс фіксації Райта (Fis), ефективну кількість алелей (ne). Частоти гаплотипів визначали шляхом розрахунку EM-алгоритму за використання програми EH+. Розрахунки стандартизованої міри відхилу за зчепленням від рівноважного стану проводили з використанням програми 2LD. За результатами проведених досліджень виявлений поліморфізм за обома дослідними локусами у популяції корів української чорно-рябої молочної породи. За локусом CSN2 частота алелю A1 склала 0,44; A2 – 0,56. За локусом CSN3 частота алелю A склала 0,80; алелю B – 0,20. За обома поліморфними локусами дослідна популяція корів знаходиться в стані генетичної рівноваги. За результатами аналізу розподілу частот гаплотипів з’ясовано, що найбільшу частоту зустрічальності (0,46) має гаплотип CSN2A1-CSN3A, найменшу (0,085) – CSN2A2-CSN3B. В дослідній популяції корів української чорно-рябої молочної породи не спостерігається порушення стану рівноваги за зчепленням (D′ = 0,33; що суттєво менше за критичного значення) між виявленими алельними варіантами локусів CSN2 та CSN3. Це свідчить про те, що розподіл частот гаплотипів є результатом особливостей розподілу частот відповідних алелів.
Бібліографічний список
- Eigel W. N., Butler J. E., Ernstrom C. A., Farrell H. M., Harwalkar V. R., Jenness R., Whitney R. M. Nomenclature of Proteins of Cow’s Milk: Fifth Revision. Journal of Dairy Science. 1984. Vol. 67(8). P. 1599–1631. https://doi.org/10.3168/jds.s0022-0302(84)81485-x.
- Martin P., Bianchi L., Cebo C., Miranda G. Genetic Polymorphism of Milk Proteins. Advanced Dairy Chemistry. 2012. 463–514. https://doi.org/10.1007/978-1-4614-4714-6_15.
- Jolles P., Levy-Toledano S., Fiat A.-M., Soria C., Gillessen D., Thomaidis A., Caen J. P. Analogy between fibrinogen and casein. Effect of an undecapeptide isolated from k-casein on platelet function. European Journal of Biochemistry. Vol. 158(2), P. 379–382. https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1986.tb09764.x.
- Alexander L. J., Stewart A. F., Mackinlay A. G., Kapelinskaya T. V., Tkach M., Gorodetsky S. I. Isolation and characterization of the bovine k-casein gene. European Journal of Biochemistry. 1988. Vol. 178(2), P. 395–401. https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1988.tb14463.x.
- Azevedo A. L. S., Nascimento C. S., Steinberg R. S., Carvalho M. R. S., Peixoto M. G. C. D., T’eodoro R. L., Verneque R. S., Guimarães S. E. F., Machado M. A. Genetic polymorphism of the kappa-casein gene in Brazilian cattle. Genetics and Molecular Research, Vol. 7 (3), 623–630. https://doi.org/10.4238/vol7-3gmr428.
- Cinar M. U., Akyuz B., Arslan K., & Ilgar E. G. Genotyping of the kappa-casein and beta-lactoglobulin genes in Anatolian water buffalo by PCR-RFLP. International Journal of Dairy Technology, Vol. 69(2), P. 308–311. https://doi.org/10.1111/1471-0307.12257.
- Margawati E. T., Volkandari S. D., Indriawati C. T. Genotyping of Kappa-Casein Gene of Buffalo in Indonesian. Proceedings of International Seminar on Livestock Production and Veterinary Technology. Р. 37–44. http://dx.doi.org/10.14334/Proc.Intsem.LPVT-2016-p.37-44.
- Miluchova M., Trakovicka A., Gabor Analiza polimorfismului genei β-cazeinei prin metoda PCR-RFLP pentru alelele. AI şi A2 la taurinele de rasă Pinzgau Slovacă. Lucrări ştiinţifice Zootehnie şi Biotehnologii, 2009. Vol. 42 (2).
- Review of the potential health impact of β-casomorphins and related peptides. EFSA Journal, Vol. 7(2), 231 p. https://doi.org/10.2903/j.efsa.2009.231r.
- Гуськова С. В. А2 молоко – продукция для детского питания. Информ. Бюллетень № 1 Национального союза племенных организаций. Москва. 2017.
- Ладика В. І., Скляренко Ю. І., Павленко Ю. М. Характеристика генетичної структури плідників лебединської породи за генами бета- (CSN2) та капа-казеїну (CSN3). Збірник наукових праць «Технологія виробництва і переробки продукції тваринництва» № 2, С. 88–96.
- Ладика В. І., Скляренко Ю. І., Павленко Ю. М. Аналіз бугаїв-плідників молочних порід за комплексними генотипами бета- і каппа казеїну. Розведення і генетика тварин. № 60. С. 99–109.
- Bonfatti V., Di Martino G., Cecchinato A., Degano L., Carnier P. Effects of β-κ-casein (CSN2-CSN3) haplotypes, β-lactoglobulin (BLG) genotypes, and detailed protein composition on coagulation properties of individual milk of Simmental cows. Journal of Dairy Science. Vol. 93(8), Р. 3809–3817. https://doi.org/10.3168/jds.2009-2779.
- Keating A., Smith T., Ross R., Cairns M. A note on the evaluation of a beta-casein variant in bovine breeds by allele-specific PCR and relevance to β-casomorphin. Irish Journal of Agricultural and Food Research. 2008. 47 Р. 99–.104.
- Denicourt D., Sabour M. P., McAllister A. J. Detection of bovine κ-casein genomic variants by the polymerase chain reaction method. Animal Genetics. Vol. 21(2). Р. 215–216. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1990.tb03228.x.
- Yeh F. C,. Yang R., Boyle T. J., Ye Z., Xiyan J. M. PopGene32, Microsoft Windows-based freeware for population genetic analysis, version 1.32. Biol. Biotechnol. Centre, Univ. Alberta, Edmonton, Alberta, Canada. 2000.
- Zhao J. H., Curtis D., Sham P. C. Model-free analysis and permutation tests for allelic associations. Hum Hered. 2000. 50, 133–139.
- Zapata C., Carollo C., Rodriguez S. Sampling variance and distribution of the D measure of overall gametic disequilibrium between multiallelic loci. Ann Hum Genet. Vol. 65. Р. 395–406.